Srce ovim putem želi stvoriti prostor za dijeljenje znanja, iskustava i događanja koji pridonose razvoju otvorene znanosti u Hrvatskoj i Europi. Newsletter donosi pregled aktualnosti iz područja digitalne infrastrukture, projekata i politika vezanih uz otvoreni pristup, otvorene podatke i FAIR načela.

“U duhu FAIR principa i otvorene suradnje želimo dijeliti informacije koje su lako dostupne, pregledne i korisne”, poručuju iz Srca. Na newsletter se možete pretplatiti klikom na poveznicu.

„Novosti iz oblaka za otvorenu znanost (EOSC i HR-OOZ)” objavljivat će se mjesečno, a Srce poziva sve članove istraživačke i akademske zajednice da se uključe u njegovo oblikovanje. Prilozi i najave događanja za buduće brojeve mogu se poslati na adresu hr-ooz@srce.hr.

Izvori:

https://www.uaos.unios.hr/srce-dabarnovosti-iz-oblaka-za-otvorenu-znanost-eosc-i-hr-ooz/

https://us3.campaign-archive.com/home/?u=a1862f40dd5a31106314463cf&id=32aa926db3

Cilj EOSC-a jest izgraditi mrežu podataka i povezanih usluga temeljenih na načelima FAIR-a, a to podrazumijeva pojednostavljivanje pristupa sadržaju i uslugama putem zajedničke autentikacijsko-autorizacijske infrastrukture (AAI), promicanjem pristupa istraživačkim podacima (na FAIR načelima), omogućavanjem pristupa sustavima za pohranu, servisima za analize i računanje u oblaku, razvojem i promicanjem standarda u svrhu interoperabilnosti te uspostavljanjem sustava podrške i edukacije.

IRB je aktivni član Inicijative za Hrvatski oblak otvorene znanosti (HR-OOZ), a zajedno sa Sveučilišnim računskim centrom na nacionalnoj razini gradi informacijski sustav o hrvatskoj znanstvenoj djelatnosti CroRIS te pruža podršku tom sustavu i njegovim korisnicima.

U sklopu CroRIS-a je napravljen i modul oprema i usluge koji će okupljati informacije o hrvatskim mrežnim znanstvenim servisima te tako pomoći u procesu usklađivanja sa zahtjevima EOSC kataloga.

Primjer uspješne domaće mrežne usluge uključene u EOSC katalog je znanstveni servis za sažimanje i vizualizaciju ontologije gena – REVIGO. Usluga omogućuje korisnicima da putem mrežnog preglednika unesu listu genskih ontologija te ih potom pročiste, sažmu, grupiraju te prikažu koristeći jedan od brojnih načina prikaza.

Usluga je nastala kao rezultat istraživanja IRB-ovih znanstvenika te je danas globalno vrlo popularna mrežna usluga s preko 4800 citata.

(Tekst preuzet s bloga Instituta Ruđer Bošković.)

Sudionici će na radionici steći uvid u trenutne izazove vezane uz napredak otvorene znanosti, korištenje softvera slobodnog i otvorenog koda (FOSS) u znanosti  na primjeru istraživačkih servisa i alata NI4OS- Europe zajednice, te njihove primjene u praksi. Radionica je prilika za razmjenu ideja, stjecanja novih spoznaja o ponuđenim temama i njihovu promociju.

Teme radionice:

• Kvaliteta i poboljšanje podataka o uslugama i resursima za istraživače
• Kako razviti i poboljšati istraživački softver ili uslugu te povećati njihovu vidljivost
• Kako stimulirati korištenje softvera otvorenog koda u znanosti
• Izbor licence za software otvorenog koda
• Poboljšanje kvalitete istraživanja i istraživačkih podataka

Prijave: https://events.ni4os.eu/event/85/ce code

Konferencija će se održavati 28.-29. rujna 2022. na Sveučilištu za tehnologiju i ekonomiju u Budimpešti, ali će se prenositi i online. Online sudionici neće se moći uključiti u raspravu jer će biti dostupan samo prijenos (engl. streaming). Prijaviti se možete na web stranici događaja.

NI4OS-Europe Regional Event in Budapest

Na webinaru će biti riječi o statistici korištenja kao alatu u procjeni znanstvenih rezultata, ustrojstvu i funkcijama usluege UsageCounts, kako se ona uklapa u OpenAIRE infrastrukturu i među EOSC-ove glavne usluge te postoji prilika i za pokretanje razgovora o potencijalnim problemima i brigama korisnika usluge. Više informacija i poveznicu na prijavu potražite na stranici samog događaja.

OpenAIRE-Advance predstavlja četvrtu fazu izgradnje OpenAIRE-ove e-infrastrukture za ubrzavanja otvorene znanosti, a više od 3 godine kretala se i dalje od toga prigrlivši i potičući otvorene i i FAIR (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) istraživačke podatke i softvere. Osim što je pridonio Europskom oblaku za otvorenu znanost (engl. European Open Science Cloud – EOSC) nizom usluga za ubrzanje usvajanja znanosti, projekt je donio dvije ključne inovacije. Jedna je Open Research Graph kao korak prema otvorenoj metričkoj infrastrukturi, koji prikuplja zbirku metapodataka o istraživačkim podacima i stavlja ju na raspolaganje tijelima koja financiraju znanstvena istraživanja, istraživačkim organizacijama, istraživačima, istraživačkim zajednicama i izdavačima. Druga je suradnički pristup implementiranju otvorene znanosti. Nacionalni uredi za otvoreni pristup (engl. National Open Access Desks – NOADs) u svakoj državi članici EU stvaraju dugotrajne odnose sa svim sudionicima procesa istraživanja te omogućuju suradnju s istraživačkim zajednicama i stvarateljima politika. Na taj način uvelik su pridonijeli na nacionalnoj razini. Primjerice, austrijska snažna nacionalna infrastruktura sada je potpuno usklađena s OpenAIRE smjernicama te su svi belgijski repozitoriji postali sukladni s OpenAIRE-om. Finski se NOAD aktivirao u nacionalnim radnim skupinama za otvorenu znanost, a turski NOAD je odgovoran za uključivanje koncepta plana otvorene znanosti (Open Science roadmap) u nacionalni program.

Osim navedenog, tim projekta preuzeo je i promoviranje otvorene znanosti. Organizirano je sveukupno 50 nacionalnih radionica, proizvedeni su materijali za učenje i organizirano je 500 događaja za obuku.

OpenAIRE-Advance nije stao na granicama EU. Jedan od glavnih fokusa projekta bilo je i pokretanje svjetskog dijaloga s repozitorijima van Europe. Latinoamerička La Referencia uspješno je integrirana s OpenAIRE infrastrukturom, a u Africi je pokrenuta mreža repozitorija. U Kanadi je razvijen regionalni portal za rezultate istraživanja, te je kolaboracija s Ujedinjenim narodima (UN) rezultirala sadržajem u otvorenom pristupu na platformi UN2030.

Projekt OpenAIRE Nexus nastavlja s usmjeravanjem otvorene znanosti u Europi i usredotočit će se na kontinuirani rad OpenAIRE usluga.

Više pročitajte na: https://ec.europa.eu/research-and-innovation/en/projects/success-stories/all/openaire-advance-helps-move-europe-further-down-open-science-path

NI4OS katalog nudi nekoliko tematskih resursa:

• FEPrepare – automatizira postupak izvođenja NAMD/FEP simulacija
• DREAMM – analizira površinu perifernih membranskih proteina
• NanoCrystal – kristalografski alat namijenjen stvaranju koordinata nanočestica iz bilo kojeg materijala kristalne strukture
• Schrödinger API – nudi napredne metode u rješavanju višedimenzionalne vremenski neovisne Schrödingerove jednadžbe
• ChemBioServer – filtrira i grupira kemijske spojeve koji se koriste u procesu otkrivanja i razvoja lijekova
• Gaussian API – service for fitting repulsive potentials in density-functional tight-binding with Gaussian process regression

Zahvaljujući doprinosu NI4OS-Europe projekta, znanstvena zajednica korak je bliže ostvarenju vizije Europskog oblaka za otvorenu znanost. Osim što je postavio snažne temelje koji omogućuju implementaciju EOSC-a, NI4OS-Europe svojim aktivnostima znanstvenicima širom svijeta omogućava pristup, pohranu, upravljanje, analizu, dijeljenje i ponovnu upotrebu istraživačkih podataka.

Podaci trebaju biti pronalažljivi (Findable), dostupni (Accessible), interoperabilni (Interoperable) te ponovo upotrebljivi (Reusable). Plan je na jednom mjestu okupiti institucionalne, nacionalne i europske inicijative te uključiti sve relevantne dionike da zajedno dizajniraju i implementiraju europske zajedničke istraživačke podatke.

Kako bi se omogućio distribucijski kanal za dijeljenje informacija 2018. godine pokrenut je EOSC portal. Namijenjen je pružateljima servisa i usluga, ali i krajnjim korisnicima. Krajem 2019. godine pokrenut je projekt EOSC Enhance čiji je cilj daljnji razvoj funkcionalnosti EOSC portala. Ciljevi su objedinjeni unutar sljedećih kategorija: poboljšati sučelje za pružatelje usluga i uključivanje novih izvora (resursa) i usluga u EOSC katalog (Enhance), ubrzati njihovu primjenu (Accelerate), povećati potražnju korisnika za EOSC uslugama i resursima (Increase) i omogućiti otvoreni pristup putem tematskih portala/oblaka (Enable). Kao rezultat u prosincu 2020. godine pokrenut je novi EOSC Portal. U svrhu upoznavanja s novim EOSC portalom u ponudi su brojni webinari koji pokrivaju različite aspekte portala.

Osim osnovnih informacija o EOSC (Inicijativi), EOSC projektima, putem portala moguć je pristup brojnim izvorima informacija i servisima, kao i objava, pretraživanje i korištenje podataka i usluga. Kako bi se izbjegle nejasnoće oko terminologije koja se koristi dostupan je EOSC rječnik, a odgovore na nedoumice korisnici i pružatelji usluga mogu naći u odgovorima na učestala pitanja.

Informacije i pristup postojećim servisima dostupni su putem pretraživanja ili prebiranjem unutar kataloga i tržnice (Catalogue and Marketplace). Dostupni su i brojni filteri kojima je moguće suziti pretraživanje/prebiranje.

Kod prebiranja informacije su razvrstane prema područjima znanosti ili kategorijama.

Kako bi se krajnjim korisnicima olakšalo snalaženje unutar EOSC portala objavljen je i praktičan EOSC vodič za krajnje korisnike. Osim ovog vodiča na stranici “Using the portal“, dostupne su i druge publikacije. Dostupna dokumentacije podijeljena je u dvije grupacije: za pružatelje usluga i za krajnje korisnike. Sve novosti i najave događanja vezane uz EOSC objavljuju se u sekciji “Media”, a također su dostupne prezentacije s održanih webinara. Kako bi se korinicima olakšao pristup i pronalaženje informacija radi se na daljnjem razvoju portala.

U okviru NI4OS projekta koji brojnim aktivnostima radi na uspostavi i promociji Europskog oblaka za otvorenu znanost objavljeni su dokumenti o EOSC-u i FAIR principima na hrvatskom jeziku koji su dostupni na stranicama projekta.

Korisne poveznice:

Europski oblak za otvorenu znanost EOSC

Sve što trebate znati o FAIR podacima